Спасибо за Победу!
В апреле 1941 года Городовиков был направлен в Серпуховское авиационное училище, которое закончил в июне того же года с присвоением звания лётчика со сдачей высшего пилотажа.
6 июля 1941 года Б. Б. Городовиков назначен в Полтавскую область командиром 71-го кавалерийского полка 48-й Отдельной кавалерийской дивизии с присвоением звания «подполковник». Вскоре дивизия была переброшена в Крым. Первое сражение полка произошло 19 октября 1941 года в Крыму, под Перекопом, на Ишуньских позициях. За успешные операции в роли партизана Б. Б. Городовиков 7 апреля 1942 года был награждён орденом Красного Знамени, 26 апреля ему было присвоено воинское звание полковника.
1 мая 1942 года полковник Городовиков назначается командиром 1-го Партизанского района в Крыму.
В августе 1942 года назначен командиром 251-й Витебской стрелковой дивизии Западного фронта. Дивизия участвует в Погорело-Городищенской операции 20-й армии Западного фронта. Освобождает Погорелое Городище, форсирует Вазузу и втягивается в долгие бои на плацдарме. С 25 ноября 1942 года дивизия участвует в операции «Марс». После её окончания продолжает вести кровопролитные бои в междуречье Вазузы и Осуги. 8 марта 1943 года 251-я стрелковая дивизия участвует в освобождении города Сычёвка. 22 декабря 1942 года Городовиков был награждён медалью «За оборону Севастополя». 2 марта 1943 года награждён орденом Красного Знамени за успешное проведение мартовских операций.
27 июля 1943 года назначен командиром 85-й гвардейской стрелковой дивизии 15-го гвардейского стрелкового корпуса. В августе 1943 года дивизия под командованием полковника Городовикова прорвала хорошо укреплённую оборонительную полосу противника в районе Рисовы, и ведя непрерывные упорные бои, уничтожила противника и заняла населённые пункты Речица, Кобели, Моссалы, Ляды, Мартынково и обеспечила успешное продвижение вперёд наступающим частям. За умело проведённый прорыв хорошо укреплённой обороны противника, личную отвагу и мужество, Б. Б. Городовиков был аттестован на присвоение генеральского звания.
После стабилизации обстановки на Западном фронте 10-я гвардейская армия была переброшена в ноябре 1943 года на II Прибалтийский фронт и использовалась при прорывах в первом эшелоне наступающих войск.
В июне 1944 года Б. Б. Городовиков был назначен командиром 184-й Духовщинской стрелковой дивизии 45-го стрелкового корпуса 5-й армии 3-го Белорусского фронта. Продолжая развивать стратегическую инициативу, советские войска летом 1944 года развернули мощное наступление по всей линии фронта от Карелии до Молдавии. 23 июня 1944 года началась наступательная операция «Багратион» на территории Белоруссии. В ней принимала участие 184-я стрелковая дивизия генерал-майора Городовикова в составе 3-го Белорусского фронта. Под Витебском дивизия Городовикова, отрезав пути отхода 206-й немецкой пехотной дивизии, разгромила её и взяла в плен около 3 тысяч немецких солдат и офицеров во главе с командиром, и преследуя отходящие вражеские части, вступила на территорию Литовской ССР. 12 июля 1944 года 184-я стрелковая дивизия совместно с воинами 45-го стрелкового корпуса взяла литовский город Тракай.
29 июля 1944 года 184-я стрелковая дивизия прорвала оборону немецких войск, захватила важный узел шоссейных дорог, чем содействовала окружению вермахта в районе Каунаса. Основной удар немцев на рубеже Жвиргждайгяй — Блювы — Матерны — Слобода пришёлся на дивизию Городовикова. В ходе этих боёв было уничтожено 19 вражеских танков, 4 бронетранспортёра, 7 автомашин, 66 пулемётов, 3 миномёта, убито 1410 солдат и офицеров.
Успешно форсировав реку Неман, дивизия генерал-майора Б. Б. Городовикова 17 августа 1944 года первой из советских соединений вышла к Государственной границе СССР с гитлеровской Германией (Восточная Пруссия) северо-западнее города Вилкавишкиса (Литовская ССР), в районе города Наумиестис (Кудиркос-Науместис), который впоследствии и освобождала от оккупантов — 16 октября 1944 года. Указом Президиума Верховного Совета СССР от 19 апреля 1945 года за умелое командование дивизией и проявленные при этом мужество и героизм Б. Б. Городовикову присвоено звание Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали «Золотая Звезда»
В ночь на 15 октября 1944 года войска 3-го Белорусского фронта перешли в наступление вдоль всей границы с Восточной Пруссией. Линия обороны противника перед фронтом наступления 184-й стрелковой дивизии была сильно укреплена. Но несмотря на это, с поставленной задачей дивизия справилась успешно, а её батальон под командованием Г. Н. Губкина первым вступил на территорию Восточной Пруссии. В городе Ширвиндте, взятом во второй половине октября 1944 года 184-й дивизией, генерал Городовиков принял первый парад победы советских войск на территории Германии.
2 декабря 1944 года Городовиков получил тяжёлое ранение и был эвакуирован в военный госпиталь в Москве. По окончании лечения, в феврале 1945 года вновь принял командование 184-й стрелковой дивизией, участвовал в Восточно-Прусской операции. После завершения Земландской наступательной операции дивизия начала переброску на Дальний Восток. С июля 1945 года — командир 63-й стрелковой дивизии 72-го стрелкового корпуса 5-й армии 1-го Дальневосточного фронта. Участник советско-японской войны в августе 1945 года, в которой дивизия под его командованием успешно наступала в Маньчжурии. Был прорван крупный укрепрайон, пройден горный хребет и освобождены города Ванцин и Гирин.